微通道反应器并不适合所有的化学反应。虽然微通道反应器相对于传统的釜式反应器有许多优点，如对反应温度的精准控制，比表面积大，传递速率高，接触时间短，副产物少，安全性高，操作性好等。但是，由于其反应器通道比较小，一般是几个毫米，因此有固体参与的反应则很难进行。
适合微通道反应器的反应类型主要包括：
1、正常液-液均相或液-液非均相；
2、必须是快反应的反应体系，因为反应器的通道一般停留时间在几分钟，反应太慢的则不适合；
3、强放热反应更适合用反应器来实现，通常有硝化反应、重氮化反应、磺化反应、氧化反应（液体氧化剂）等。
然而，微通道反应器也存在一些缺点：
固体物料无法通过微通道，如果反应中有大量固体产生，微通道极易堵塞，导致生产无法连续进行；
微反应器的数量大大增加时，微反应器的检测和控制的复杂程度大大增加，成本也相应增加；
因此，虽然微通道反应器在某些方面具有优势，但并不适合所有类型的化学反应。在使用微通道反应器之前，需要根据具体的反应类型和条件进行详细的评估。
